Arraylet Chromosome Genomic_Start Genomic_End Genomic_Length Affymetrix_Probe_Start Affymetrix_Probe_End Affymetrix_Probe_Length LGA_Segment_Mean Tumor_1 1 51586 247190999 247139413 1 72745 72745 3.00E-04 Tumor_1 2 2772 242738117 242735345 72746 150247 77502 1.00E-04 Tumor_1 3 35333 199380503 199345170 150248 215637 65390 0 Tumor_1 4 2269 34455437 34453168 215638 226917 11280 1.00E-04 Tumor_1 4 34462883 34501108 38225 226918 226955 38 -0.0017 Tumor_1 4 34506255 191261892 156755637 226956 278336 51381 2.00E-04 Tumor_1 5 68520 180722914 180654394 278337 336024 57688 0 Tumor_1 6 94649 170892918 170798269 336025 390998 54974 0 Tumor_1 7 52899 142154217 142101318 390999 437975 46977 2.00E-04 Tumor_1 7 142156282 142165672 9390 437976 438003 28 0.0025 Tumor_1 7 142165902 158819753 16653851 438004 443446 5443 2.00E-04 Tumor_1 8 21242 146268947 146247705 443447 491648 48202 2.00E-04 Tumor_1 9 37451 140211203 140173752 491649 530975 39327 2.00E-04 Tumor_1 10 62797 135356682 135293885 530976 574804 43829 -1.00E-04 Tumor_1 11 188560 134442929 134254369 574805 618292 43488 1.00E-04 Tumor_1 12 20691 132288250 132267559 618293 661624 43332 1.00E-04 Tumor_1 13 17924937 114126487 96201550 661625 692481 30857 -2.00E-04 Tumor_1 14 18072112 106356016 88283904 692482 720539 28058 0 Tumor_1 15 18276329 100286551 82010222 720540 747114 26575 -1.00E-04 Tumor_1 16 765 88815024 88814259 747115 772526 25412 1.00E-04 Tumor_1 17 514 78638434 78637920 772527 797677 25151 1.00E-04 Tumor_1 18 38121 76115098 76076977 797678 822488 24811 0 Tumor_1 19 41898 63789654 63747756 822489 840282 17794 4.00E-04 Tumor_1 20 9293 62426585 62417292 840283 860347 20065 3.00E-04 Tumor_1 21 9758730 46921373 37162643 860348 872478 12131 0 Tumor_1 22 14432516 49581309 35148793 872479 884887 12409 -1.00E-04 Tumor_1 23 108465 88888705 88780240 884888 912286 27399 -5.00E-04 Tumor_1 23 88891910 88895120 3210 912287 912288 2 0.0107 Tumor_1 23 88898635 154835536 65936901 912289 933827 21539 -4.00E-04 Tumor_1 1 554268 3765501 3211234 32 608 577 -6.86E-05 Tumor_2 1 3777639 10571752 6794114 613 2693 2081 -0.000263544 Tumor_2 1 10584836 13647633 3062798 2694 3390 697 -0.000153173 Tumor_2 1 13654754 14427112 772359 3393 3651 259 -2.12E-05 Tumor_2 1 14461404 25457903 10996500 3664 7029 3366 -0.000137868 Tumor_2 1 25488923 25529549 40627 7045 7057 13 4.52E-05 Tumor_2 1 25536086 32669539 7133454 7063 9020 1958 8.99E-06 Tumor_2 1 32695245 33293362 598118 9029 9201 173 -5.45E-05 Tumor_2 1 33300127 83369717 50069591 9203 25758 16556 0.000102549 Tumor_2 1 83388826 83695596 306771 25764 25845 82 9.91E-05 Tumor_2 1 83737764 161009860 77272097 25858 43322 17465 0.000107846 Tumor_2 1 161020691 161056083 35393 43327 43330 4 0.000525373 Tumor_2 1 161061712 202347595 41285884 43331 57852 14522 0.000126021 Tumor_2 1 202364053 203090915 726863 57858 58134 277 0.002257927 Tumor_2 1 203102540 240470722 37368183 58137 70377 12241 1.91E-05 Tumor_2 1 240487783 240553089 65307 70382 70398 17 8.62E-05 Tumor_2 1 240579530 247190718 6611189 70410 72744 2335 0.000109056 Tumor_2 2 20341 91391623 91371283 72753 102613 29861 -1.06E-05 Tumor_2 2 91435969 94882087 3446119 102619 102712 94 -0.000199199 Tumor_2 2 94892170 113884346 18992177 102717 108390 5674 -5.61E-05 Tumor_2 2 113911006 114032382 121377 108395 108402 8 -6.49E-05 Tumor_2 2 114146308 242488979 128342672 108422 150133 41712 0.000112531 Tumor_2 2 242492286 242596654 104369 150134 150154 21 0.000126791 Tumor_2 2 242602220 242717016 114797 150155 150244 90 0.000186204 Tumor_2 3 39066 199379566 199340501 150250 215633 65384 0.000159387 Tumor_2 4 41413 46772 5360 215681 215686 6 -0.000254262 Tumor_2 4 62447 48777988 48715542 215698 231662 15965 -6.48E-06 Tumor_2 4 48910295 62413272 13502978 231680 235201 3522 0.000316849 Tumor_2 4 62421048 104027107 41606060 235204 248768 13565 0.000325126 Tumor_2 4 104047267 104072115 24849 248772 248776 5 0.000290849 Tumor_2 4 104086799 191173837 87087039 248781 278327 29547 0.000441851 Tumor_2 5 90692 180629353 180538662 278348 336020 57673 3.79E-05 Tumor_2 6 97634 63406800 63309167 336030 354766 18737 -0.000185307 Tumor_2 6 63467177 170748662 107281486 354780 390989 36210 -0.000676505 Tumor_2 6 170762955 170867396 104442 390995 390996 2 -0.001845035 Tumor_2 7 140213 1032780 892568 391002 391124 123 0.00116534 Tumor_2 7 1036793 1040705 3913 391125 391125 1 0.00202651 Tumor_2 7 1047707 39624922 38577216 391130 404583 13454 0.001456949 Tumor_2 7 39633535 39802523 168989 404586 404639 54 0.001418795 Tumor_2 7 39813909 52114925 12301017 404645 408798 4154 0.00140628 Tumor_2 7 52149644 53977549 1827906 408812 409497 686 0.001721081 Tumor_2 7 54027937 54544164 516228 409516 409751 236 0.0027563 Tumor_2 7 54566257 54673962 107706 409755 409794 40 0.003835487 Tumor_2 7 54705682 55295156 589475 409809 410173 365 0.005892525 Tumor_2 7 55349637 55543144 193508 410191 410249 59 0.003474066 Tumor_2 7 55556230 55641775 85546 410255 410286 32 0.003133744 Tumor_2 7 55680713 56099026 418314 410308 410433 126 0.002500546 Tumor_2 7 56102143 56646181 544039 410434 410581 148 0.001646837 Tumor_2 7 56654535 80092754 23438220 410586 416331 5746 0.001656616 Tumor_2 7 80100332 80629694 529363 416334 416515 182 0.001904692 Tumor_2 7 80650984 97340676 16689693 416523 422594 6072 0.001947314 Tumor_2 7 97355553 97383757 28205 422596 422598 3 0.001238636 Tumor_2 7 97406212 127885389 30479178 422600 433157 10558 0.001882525 Tumor_2 7 127892509 127947649 55141 433161 433172 12 0.001101591 Tumor_2 7 127974303 158811268 30836966 433180 443437 10258 0.001761507 Tumor_2 8 63810 7040596 6976787 443447 446427 2981 9.33E-05 Tumor_2 8 7256229 7789937 533709 446467 446577 111 -0.000397512 Tumor_2 8 8132139 47658706 39526568 446678 458850 12173 0.000217336 Tumor_2 8 47693177 47740011 46835 458868 458880 13 7.86E-05 Tumor_2 8 47762604 146264846 98502243 458888 491644 32757 0.000116222 Tumor_2 9 153131 19593559 19440429 491663 499339 7677 -0.001039358 Tumor_2 9 19716199 25969531 6253333 499389 501742 2354 -0.00250929 Tumor_2 9 26123251 33227011 7103761 501796 504357 2562 -0.0013743 Tumor_2 9 33238412 45419207 12180796 504361 506486 2126 -0.000625874 Tumor_2 9 46018067 140193674 94175608 506515 530968 24454 -5.32E-05 Tumor_2 10 115544 21886103 21770560 530984 538622 7639 -0.002636184 Tumor_2 10 21895687 21920526 24840 538626 538629 4 -0.00266022 Tumor_2 10 21928812 27556323 5627512 538632 540474 1843 -0.002739181 Tumor_2 10 27560671 27577201 16531 540476 540479 4 -0.00148507 Tumor_2 10 27582425 38585875 11003451 540480 544233 3754 -0.002386733 Tumor_2 10 38596435 42150759 3554325 544237 544380 144 -0.001442328 Tumor_2 10 42184626 70032920 27848295 544390 553331 8942 -0.002163897 Tumor_2 10 70041778 70059659 17882 553336 553339 4 -0.002543465 Tumor_2 10 70065964 72316941 2250978 553340 554100 761 -0.002307234 Tumor_2 10 72324240 72328673 4434 554105 554105 1 -0.001629942 Tumor_2 10 72336589 75051673 2715085 554107 554931 825 -0.002380705 Tumor_2 10 75069380 75081501 12122 554934 554935 2 -0.001451003 Tumor_2 10 75086802 81952099 6865298 554937 557042 2106 -0.00240381 Tumor_2 10 81961869 81996286 34418 557047 557055 9 -0.002840312 Tumor_2 10 82006502 119285499 37278998 557061 569604 12544 -0.002291672 Tumor_2 10 119295569 119317101 21533 569605 569610 6 -0.002433429 Tumor_2 10 119328935 125851068 6522134 569616 571923 2308 -0.002351207 Tumor_2 10 125858747 125942780 84034 571927 571934 8 -0.002141657 Tumor_2 10 125976990 127563278 1586289 571946 572419 474 -0.002357312 Tumor_2 10 127578239 127603523 25285 572426 572432 7 -0.001842422 Tumor_2 10 127612803 135356671 7743869 572436 574801 2366 -0.00244261 Tumor_2 11 182372 37682396 37500025 574803 587555 12753 0.00016974 Tumor_2 11 37709223 54813741 17104519 587568 591835 4268 -3.50E-05 Tumor_2 11 54836429 134432265 79595837 591848 618286 26439 -0.000211638 Tumor_2 12 33854 264310 230457 618294 618353 60 -0.000703686 Tumor_2 12 274945 22791468 22516524 618355 625779 7425 -0.000525324 Tumor_2 12 22809936 23015035 205100 625784 625861 78 -0.000651295 Tumor_2 12 23028928 56110139 33081212 625868 636208 10341 -0.000211179 Tumor_2 12 56113786 56851707 737922 636210 636457 248 0.000704646 Tumor_2 12 56878227 57171746 293520 636466 636592 127 5.98E-05 Tumor_2 12 57212364 58307716 1095353 636603 637026 424 0.000126261 Tumor_2 12 58315838 60686403 2370566 637032 637832 801 0.000161708 Tumor_2 12 60693922 60799336 105415 637836 637861 26 0.000171406 Tumor_2 12 60810740 65805659 4994920 637865 639507 1643 0.000130179 Tumor_2 12 65841438 65967585 126148 639520 639553 34 0.000200347 Tumor_2 12 65975939 67390052 1414114 639557 640006 450 0.000263303 Tumor_2 12 67395702 67981127 585426 640009 640218 210 0.000981139 Tumor_2 12 68008695 69188981 1180287 640225 640579 355 0.001084467 Tumor_2 12 69197447 70289887 1092441 640583 640911 329 0.000326186 Tumor_2 12 70299341 70641825 342485 640914 641031 118 0.000298682 Tumor_2 12 70658947 132289090 61630144 641038 661622 20585 0.000173037 Tumor_2 13 18194527 114123862 95929336 661669 692477 30809 -0.000259853 Tumor_2 14 18149473 106349756 88200284 692486 720534 28049 -0.000711992 Tumor_2 15 18362555 100200937 81838383 720554 747091 26538 -0.000146752 Tumor_2 16 28087 88690571 88662485 747120 772522 25403 -0.000409376 Tumor_2 17 59739 57838106 57778368 772544 791270 18727 0.000111792 Tumor_2 17 57851812 57973757 121946 791275 791308 34 -0.000067824 Tumor_2 17 57992993 78638467 20645475 791313 797677 6365 0.00011367 Tumor_2 18 4316 75432 71117 797678 797681 4 -0.000109637 Tumor_2 18 121700 76009131 75887432 797690 822451 24762 -0.000252768 Tumor_2 18 76027136 76110964 83829 822460 822485 26 -0.000260787 Tumor_2 19 217117 33277915 33060799 822502 829749 7248 0.000110915 Tumor_2 19 33329393 35322055 1992663 829766 830578 813 -9.78E-05 Tumor_2 19 35388639 63784327 28395689 830602 840279 9678 0.000279673 Tumor_2 20 8747 26129166 26120420 840283 849327 9045 0.000308308 Tumor_2 20 26156026 28266113 2110088 849336 849424 89 6.00E-05 Tumor_2 20 29297270 62379059 33081790 849425 860339 10915 0.000272377 Tumor_2 21 9896630 46914686 37018057 860357 872473 12117 0.00019735 Tumor_2 22 14504218 22093846 7589629 872490 875021 2532 -0.000553773 Tumor_2 22 22104072 22124493 20422 875025 875030 6 -0.001040814 Tumor_2 22 22131936 23033597 901662 875033 875363 331 -0.000848759 Tumor_2 22 23042106 44865839 21823734 875370 883295 7926 -0.000556129 Tumor_2 22 44877684 44926083 48400 883297 883302 6 -0.000700181 Tumor_2 22 44932185 49565816 4633632 883307 884883 1577 -0.000581339 Tumor_2 23 2719027 154570177 151851151 884983 933796 48814 7.50E-05 Normal_53 1 51586 25455916 25404330 1 7029 7029 1.00E-04 Normal_53 1 25465703 25519521 53818 7030 7056 27 0.0024 Normal_53 1 25519561 105822730 80303169 7057 33190 26134 0 Normal_53 1 105822892 105823886 994 33191 33200 10 0.0022 Normal_53 1 105825566 110034485 4208919 33201 34643 1443 0 Normal_53 1 110034564 110041689 7125 34644 34657 14 0.0046 Normal_53 1 110044464 227877780 117833316 34658 66095 31438 0 Normal_53 1 227883467 227886807 3340 66096 66098 3 -0.0035 Normal_53 1 227887067 247190999 19303932 66099 72745 6647 0 Normal_53 2 2772 35829465 35826693 72746 84815 12070 0 Normal_53 2 35831282 35841408 10126 84816 84821 6 0.0038 Normal_53 2 35841439 126158681 90317242 84822 112336 27515 0 Normal_53 2 126168109 126168371 262 112337 112338 2 0.0066 Normal_53 2 126168390 208058424 81890034 112339 139244 26906 0 Normal_53 2 208058480 208067569 9089 139245 139265 21 0.0023 Normal_53 2 208067709 242738117 34670408 139266 150247 10982 0 Normal_53 3 35333 99381998 99346665 150248 182146 31899 0 Normal_53 3 99391348 99396103 4755 182147 182148 2 0.0055 Normal_53 3 99397495 170830285 71432790 182149 205942 23794 0 Normal_53 3 170832544 170833286 742 205943 205944 2 0.0042 Normal_53 3 170836534 199380503 28543969 205945 215637 9693 0 Normal_53 4 2269 34455387 34453118 215638 226914 11277 0 Normal_53 4 34455408 34506255 50847 226915 226956 42 -0.0019 Normal_53 4 34506296 68943134 34436838 226957 237417 10461 0 Normal_53 4 68943647 68970725 27078 237418 237423 6 0.0045 Normal_53 4 68977382 70162221 1184839 237424 237703 280 -4.00E-04 Normal_53 4 70162229 70266376 104147 237704 237755 52 -0.0025 Normal_53 4 70266599 190425792 120159193 237756 278087 40332 0 Normal_53 4 190432100 190436246 4146 278088 278091 4 0.0043 Normal_53 4 190436753 191261892 825139 278092 278336 245 -1.00E-04 Normal_53 5 68520 21485021 21416501 278337 285746 7410 -1.00E-04 Normal_53 5 21486945 21488183 1238 285747 285751 5 0.0034 Normal_53 5 21488241 57349962 35861721 285752 296496 10745 0 Normal_53 5 57361772 57369278 7506 296497 296528 32 0.0034 Normal_53 5 57403338 140204008 82800670 296529 323118 26590 0 Normal_53 5 140211693 140223928 12235 323119 323127 9 -0.0021 Normal_53 5 140232335 150182386 9950051 323128 326259 3132 0 Normal_53 5 150185681 150198785 13104 326260 326267 8 -0.0023 Normal_53 5 150204276 177131043 26926767 326268 334986 8719 0 Normal_53 5 177160145 177165199 5054 334987 334989 3 0.0065 Normal_53 5 177187559 180304762 3117203 334990 335921 932 1.00E-04 Normal_53 5 180311304 180347059 35755 335922 335935 14 -0.0026 Normal_53 5 180349801 180722914 373113 335936 336024 89 0 Normal_53 6 94649 31394272 31299623 336025 345845 9821 0 Normal_53 6 31394498 31404418 9920 345846 345853 8 -0.0037 Normal_53 6 31456437 54039222 22582785 345854 352836 6983 0 Normal_53 6 54039327 54039802 475 352837 352840 4 0.0036 Normal_53 6 54043295 67090524 13047229 352841 356069 3229 0 Normal_53 6 67097622 67099901 2279 356070 356076 7 0.0027 Normal_53 6 67100067 134307949 67207882 356077 378819 22743 0 Normal_53 6 134310752 134311313 561 378820 378821 2 0.0053 Normal_53 6 134319727 157701240 23381513 378822 386818 7997 0 Normal_53 6 157716052 157749593 33541 386819 386820 2 -0.0045 Normal_53 6 157790038 170892918 13102880 386821 390998 4178 0 Normal_53 7 52899 158819753 158766854 390999 443446 52448 0 Normal_53 8 21242 39349804 39328562 443447 457167 13721 0 Normal_53 8 39354748 39506110 151362 457168 457223 56 -0.0045 Normal_53 8 39507444 146268947 106761503 457224 491648 34425 0 Normal_53 9 37451 67673789 67636338 491649 506599 14951 0 Normal_53 9 67675859 67675867 8 506600 506604 5 0.0039 Normal_53 9 67678148 140211203 72533055 506605 530975 24371 0 Normal_53 10 62797 4280802 4218005 530976 532483 1508 0 Normal_53 10 4280826 4281004 178 532484 532486 3 0.0043 Normal_53 10 4287241 24417669 20130428 532487 539416 6930 0 Normal_53 10 24417670 24418048 378 539417 539425 9 0.0037 Normal_53 10 24418902 47417388 22998486 539426 545873 6448 0 Normal_53 10 47432893 47468054 35161 545874 545876 3 -0.004 Normal_53 10 47480470 135356682 87876212 545877 574804 28928 0 Normal_53 11 188560 4926807 4738247 574805 576037 1233 1.00E-04 Normal_53 11 4926841 4933442 6601 576038 576075 38 -0.0026 Normal_53 11 4933456 134442929 129509473 576076 618292 42217 0 Normal_53 12 20691 11113965 11093274 618293 621717 3425 1.00E-04 Normal_53 12 11115944 11132787 16843 621718 621725 8 -0.0028 Normal_53 12 11143129 33185915 22042786 621726 629396 7671 0 Normal_53 12 33192661 33198629 5968 629397 629419 23 -0.0023 Normal_53 12 33199615 33278012 78397 629420 629449 30 -1.00E-04 Normal_53 12 33280084 33286673 6589 629450 629454 5 -0.0031 Normal_53 12 33290342 44190693 10900351 629455 632525 3071 0 Normal_53 12 44192095 44195792 3697 632526 632528 3 0.0053 Normal_53 12 44199547 132288250 88088703 632529 661624 29096 0 Normal_53 13 17924937 71372286 53447349 661625 678911 17287 0 Normal_53 13 71375544 71378545 3001 678912 678915 4 0.0045 Normal_53 13 71378594 114126487 42747893 678916 692481 13566 0 Normal_53 14 18072112 73070864 54998752 692482 709928 17447 0 Normal_53 14 73076448 73090720 14272 709929 709936 8 0.0039 Normal_53 14 73099641 105609095 32509454 709937 720181 10245 0 Normal_53 14 105612786 105632474 19688 720182 720193 12 -0.0051 Normal_53 14 105638133 105867730 229597 720194 720297 104 -1.00E-04 Normal_53 14 105872388 105873086 698 720298 720301 4 -0.004 Normal_53 14 105886976 106356016 469040 720302 720539 238 1.00E-04 Normal_53 15 18276329 74678670 56402341 720540 738445 17906 0 Normal_53 15 74678784 74682241 3457 738446 738456 11 0.0027 Normal_53 15 74682387 100286551 25604164 738457 747114 8658 0 Normal_53 16 765 88815024 88814259 747115 772526 25412 0 Normal_53 17 514 78638434 78637920 772527 797677 25151 1.00E-04 Normal_53 18 38121 76115098 76076977 797678 822488 24811 0 Normal_53 19 41898 63789654 63747756 822489 840282 17794 1.00E-04 Normal_53 20 9293 62426585 62417292 840283 860347 20065 0 Normal_53 21 9758730 46921373 37162643 860348 872478 12131 0 Normal_53 22 14432516 22667937 8235421 872479 875220 2742 1.00E-04 Normal_53 22 22674410 22726802 52392 875221 875240 20 -0.0017 Normal_53 22 22731517 49581309 26849792 875241 884887 9647 1.00E-04 Normal_53 23 108465 115047697 114939232 884888 920746 35859 -0.0026 Normal_53 23 115051971 115064654 12683 920747 920753 7 0.0033 Normal_53 23 115070435 154835536 39765101 920754 933827 13074 -0.0027 Tumor_53 1 51586 25455916 25404331 1 7029 7029 -1.00E-04 Tumor_53 1 25465703 25519521 53819 7030 7056 27 0.0028 Tumor_53 1 25519561 34864249 9344689 7057 9682 2626 0 Tumor_53 1 34875229 34877066 1838 9683 9701 19 -0.0024 Tumor_53 1 34889136 105814887 70925752 9702 33183 23482 -1.00E-04 Tumor_53 1 105820716 105823886 3171 33184 33200 17 0.002 Tumor_53 1 105825566 110029026 4203461 33201 34642 1442 -2.00E-04 Tumor_53 1 110034485 110041689 7205 34643 34657 15 0.0058 Tumor_53 1 110044464 114807559 4763096 34658 36339 1682 -4.00E-04 Tumor_53 1 114808477 114821007 12531 36340 36343 4 0.0019 Tumor_53 1 114825044 147815325 32990282 36344 39156 2813 -2.00E-04 Tumor_53 1 147815338 147845334 29997 39157 39158 2 -0.004 Tumor_53 1 147884063 150822318 2938256 39159 40095 937 -3.00E-04 Tumor_53 1 150822379 150853206 30828 40096 40128 33 -0.0032 Tumor_53 1 150857106 208137673 57280568 40129 59741 19613 -1.00E-04 Tumor_53 1 208148224 208150595 2372 59742 59744 3 0.0043 Tumor_53 1 208153163 227877780 19724618 59745 66095 6351 0 Tumor_53 1 227883467 227886807 3341 66096 66098 3 -0.0052 Tumor_53 1 227887067 247190999 19303933 66099 72745 6647 0 Tumor_53 2 2772 13719155 13716384 72746 77534 4789 0.0011 Tumor_53 2 13721700 13722213 514 77535 77536 2 0.0066 Tumor_53 2 13732517 35829465 22096949 77537 84815 7279 2.00E-04 Tumor_53 2 35831282 35841408 10127 84816 84821 6 0.0055 Tumor_53 2 35841439 52608373 16766935 84822 90376 5555 -2.00E-04 Tumor_53 2 52612245 52635034 22790 90377 90409 33 0.0023 Tumor_53 2 52645616 106249649 53604034 90410 106330 15921 0 Tumor_53 2 106249751 106251777 2027 106331 106337 7 -0.0033 Tumor_53 2 106264800 126158681 19893882 106338 112336 5999 1.00E-04 Tumor_53 2 126168109 126168371 263 112337 112338 2 0.0083 Tumor_53 2 126168390 130510314 4341925 112339 113821 1483 2.00E-04 Tumor_53 2 130510341 130533797 23457 113822 113823 2 0.0051 Tumor_53 2 130533818 208063188 77529371 113824 139250 25427 4.00E-04 Tumor_53 2 208063411 208067569 4159 139251 139265 15 0.0033 Tumor_53 2 208067709 242738117 34670409 139266 150247 10982 2.00E-04 Tumor_53 3 35333 47453501 47418169 150248 166272 16025 0 Tumor_53 3 47466814 47467712 899 166273 166274 2 -0.0051 Tumor_53 3 47472206 99381998 51909793 166275 182146 15872 1.00E-04 Tumor_53 3 99391348 99396103 4756 182147 182148 2 0.0073 Tumor_53 3 99397495 159830708 60433214 182149 202051 19903 2.00E-04 Tumor_53 3 159833566 159834227 662 202052 202053 2 -0.0048 Tumor_53 3 159841554 163606048 3764495 202054 203327 1274 5.00E-04 Tumor_53 3 163620282 163625387 5106 203328 203341 14 0.0027 Tumor_53 3 163626930 199380503 35753574 203342 215637 12296 4.00E-04 Tumor_53 4 2269 9819380 9817112 215638 218297 2660 -2.00E-04 Tumor_53 4 9832502 9838716 6215 218298 218312 15 0.0024 Tumor_53 4 9839006 34455437 24616432 218313 226917 8605 -1.00E-04 Tumor_53 4 34462883 34501108 38226 226918 226955 38 -0.0027 Tumor_53 4 34506255 68943134 34436880 226956 237417 10462 0 Tumor_53 4 68943647 68970725 27079 237418 237423 6 0.006 Tumor_53 4 68977382 70158087 1180706 237424 237702 279 -5.00E-04 Tumor_53 4 70162221 70183734 21514 237703 237718 16 -0.0028 Tumor_53 4 70184227 70189084 4858 237719 237722 4 -0.0059 Tumor_53 4 70189122 70266376 77255 237723 237755 33 -0.0034 Tumor_53 4 70266599 115393137 45126539 237756 252656 14901 2.00E-04 Tumor_53 4 115394760 115401612 6853 252657 252679 23 0.0029 Tumor_53 4 115403666 115727061 323396 252680 252799 120 2.00E-04 Tumor_53 4 115727603 115729891 2289 252800 252802 3 -0.0033 Tumor_53 4 115735804 173225711 57489908 252803 272311 19509 2.00E-04 Tumor_53 4 173225729 173226096 368 272312 272322 11 -0.0022 Tumor_53 4 173232542 190425792 17193251 272323 278087 5765 8.00E-04 Tumor_53 4 190432100 190436246 4147 278088 278091 4 0.0055 Tumor_53 4 190436753 191261892 825140 278092 278336 245 2.00E-04 Tumor_53 5 68520 17658320 17589801 278337 284358 6022 -1.00E-04 Tumor_53 5 17662206 17674971 12766 284359 284364 6 0.0024 Tumor_53 5 17675237 21485021 3809785 284365 285746 1382 2.00E-04 Tumor_53 5 21486945 21487743 799 285747 285750 4 0.005 Tumor_53 5 21488183 46282405 24794223 285751 293860 8110 -1.00E-04 Tumor_53 5 46306753 46309147 2395 293861 293867 7 0.0018 Tumor_53 5 46309247 57349962 11040716 293868 296496 2629 -7.00E-04 Tumor_53 5 57361772 57369278 7507 296497 296528 32 0.0043 Tumor_53 5 57403338 85161584 27758247 296529 304924 8396 -1.00E-04 Tumor_53 5 85163196 85165456 2261 304925 304926 2 -0.0048 Tumor_53 5 85166355 85921102 754748 304927 305167 241 1.00E-04 Tumor_53 5 85923004 85926586 3583 305168 305169 2 0.0035 Tumor_53 5 85930325 140211737 54281413 305170 323122 17953 2.00E-04 Tumor_53 5 140211790 140223928 12139 323123 323127 5 -0.0032 Tumor_53 5 140232335 173522596 33290262 323128 333927 10800 5.00E-04 Tumor_53 5 173524628 173531535 6908 333928 333929 2 -0.0035 Tumor_53 5 173545922 177131043 3585122 333930 334986 1057 4.00E-04 Tumor_53 5 177160145 177165199 5055 334987 334989 3 0.0095 Tumor_53 5 177187559 180722914 3535356 334990 336024 1035 4.00E-04 Tumor_53 6 94649 31394272 31299624 336025 345845 9821 -2.00E-04 Tumor_53 6 31394498 31404418 9921 345846 345853 8 -0.0064 Tumor_53 6 31456437 32701367 1244931 345854 345974 121 -3.00E-04 Tumor_53 6 32703198 32796581 93384 345975 345985 11 -0.0028 Tumor_53 6 32796598 54039098 21242501 345986 352834 6849 -4.00E-04 Tumor_53 6 54039177 54039802 626 352835 352840 6 0.0031 Tumor_53 6 54043295 65393651 11350357 352841 355429 2589 1.00E-04 Tumor_53 6 65404253 65405701 1449 355430 355431 2 -0.0058 Tumor_53 6 65407522 67090524 1683003 355432 356069 638 -1.00E-04 Tumor_53 6 67097622 67099901 2280 356070 356076 7 0.0041 Tumor_53 6 67100067 134307949 67207883 356077 378819 22743 1.00E-04 Tumor_53 6 134310752 134311313 562 378820 378821 2 0.0076 Tumor_53 6 134319727 157666334 23346608 378822 386817 7996 0 Tumor_53 6 157701240 157749593 48354 386818 386820 3 -0.005 Tumor_53 6 157790038 170761408 12971371 386821 390994 4174 1.00E-04 Tumor_53 6 170824240 170892918 68679 390995 390998 4 0.0029 Tumor_53 7 52899 109228468 109175570 390999 426222 35224 -2.00E-04 Tumor_53 7 109228853 109241134 12282 426223 426232 10 -0.0043 Tumor_53 7 109241206 125832198 16590993 426233 432414 6182 -3.00E-04 Tumor_53 7 125832706 125834100 1395 432415 432427 13 0.0043 Tumor_53 7 125834101 158819753 32985653 432428 443446 11019 -3.00E-04 Tumor_53 8 21242 2235222 2213981 443447 444161 715 0 Tumor_53 8 2242033 2246753 4721 444162 444173 12 0.0026 Tumor_53 8 2258100 26930384 24672285 444174 453190 9017 2.00E-04 Tumor_53 8 26936518 26936587 70 453191 453195 5 0.0038 Tumor_53 8 26943119 39349804 12406686 453196 457167 3972 5.00E-04 Tumor_53 8 39354748 39506110 151363 457168 457223 56 -0.0057 Tumor_53 8 39507444 40891141 1383698 457224 457740 517 0.001 Tumor_53 8 40896997 40897616 620 457741 457742 2 0.0068 Tumor_53 8 40902825 88801771 47898947 457743 472642 14900 2.00E-04 Tumor_53 8 88812468 88813554 1087 472643 472644 2 -0.0054 Tumor_53 8 88817508 146268947 57451440 472645 491648 19004 5.00E-04 Tumor_53 9 37451 592891 555441 491649 491878 230 5.00E-04 Tumor_53 9 596687 596949 263 491879 491882 4 -0.0021 Tumor_53 9 597295 44364435 43767141 491883 506414 14532 3.00E-04 Tumor_53 9 44386120 44569207 183088 506415 506417 3 0.0043 Tumor_53 9 44667843 67673789 23005947 506418 506599 182 -1.00E-04 Tumor_53 9 67675859 67678355 2497 506600 506607 8 0.0048 Tumor_53 9 67699724 95509116 27809393 506608 515854 9247 2.00E-04 Tumor_53 9 95510520 95510766 247 515855 515856 2 0.0049 Tumor_53 9 95513773 140211203 44697431 515857 530975 15119 -1.00E-04 Tumor_53 10 62797 4280802 4218006 530976 532483 1508 -1.00E-04 Tumor_53 10 4280826 4281004 179 532484 532486 3 0.0069 Tumor_53 10 4287241 24415257 20128017 532487 539414 6928 -2.00E-04 Tumor_53 10 24417668 24418048 381 539415 539425 11 0.0068 Tumor_53 10 24418902 34351503 9932602 539426 542763 3338 -1.00E-04 Tumor_53 10 34353929 34354720 792 542764 542765 2 0.0022 Tumor_53 10 34357474 51265841 16908368 542766 546672 3907 1.00E-04 Tumor_53 10 51274692 51329438 54747 546673 546676 4 0.003 Tumor_53 10 51405645 51500354 94710 546677 546700 24 0 Tumor_53 10 51510978 51580592 69615 546701 546705 5 0.0035 Tumor_53 10 51607973 135356682 83748710 546706 574804 28099 2.00E-04 Tumor_53 11 188560 4924214 4735655 574805 576035 1231 7.00E-04 Tumor_53 11 4925074 4926931 1858 576036 576042 7 -0.0018 Tumor_53 11 4928569 4930297 1729 576043 576054 12 -0.0044 Tumor_53 11 4930312 134442929 129512618 576055 618292 42238 0 Tumor_53 12 20691 11111979 11091289 618293 621716 3424 1.00E-04 Tumor_53 12 11113965 11132787 18823 621717 621725 9 -0.0036 Tumor_53 12 11143129 33185915 22042787 621726 629396 7671 4.00E-04 Tumor_53 12 33192661 33198629 5969 629397 629419 23 -0.0037 Tumor_53 12 33199615 33278012 78398 629420 629449 30 0 Tumor_53 12 33280084 33286673 6590 629450 629454 5 -0.0046 Tumor_53 12 33290342 44190693 10900352 629455 632525 3071 2.00E-04 Tumor_53 12 44192095 44195792 3698 632526 632528 3 0.0072 Tumor_53 12 44199547 71006824 26807278 632529 641147 8619 -1.00E-04 Tumor_53 12 71008088 71011542 3455 641148 641149 2 0.0043 Tumor_53 12 71016574 93515254 22498681 641150 648847 7698 1.00E-04 Tumor_53 12 93517673 93526465 8793 648848 648849 2 0.0041 Tumor_53 12 93526752 132288250 38761499 648850 661624 12775 -1.00E-04 Tumor_53 13 17924937 71372286 53447350 661625 678911 17287 -2.00E-04 Tumor_53 13 71375544 71378545 3002 678912 678915 4 0.0051 Tumor_53 13 71378594 114104764 42726171 678916 692472 13557 -3.00E-04 Tumor_53 13 114107448 114126487 19040 692473 692481 9 0.0023 Tumor_53 14 18072112 73070864 54998753 692482 709928 17447 -3.00E-04 Tumor_53 14 73076448 73090720 14273 709929 709936 8 0.006 Tumor_53 14 73099641 105609095 32509455 709937 720181 10245 -4.00E-04 Tumor_53 14 105612786 105632474 19689 720182 720193 12 -0.0072 Tumor_53 14 105638133 105854077 215945 720194 720294 101 -4.00E-04 Tumor_53 14 105867058 105873086 6029 720295 720301 7 -0.0051 Tumor_53 14 105886976 106356016 469041 720302 720539 238 1.00E-04 Tumor_53 15 18276329 74678284 56401956 720540 738443 17904 1.00E-04 Tumor_53 15 74678554 74682818 4265 738444 738464 21 0.0036 Tumor_53 15 74689222 100286551 25597330 738465 747114 8650 2.00E-04 Tumor_53 16 765 29180093 29179329 747115 756163 9049 -1.00E-04 Tumor_53 16 29184283 29188544 4262 756164 756166 3 -0.0062 Tumor_53 16 29189254 54350567 25161314 756167 760972 4806 -1.00E-04 Tumor_53 16 54353878 54354083 206 760973 760976 4 0.0034 Tumor_53 16 54355711 88815024 34459314 760977 772526 11550 0 Tumor_53 17 514 78638434 78637921 772527 797677 25151 0 Tumor_53 18 38121 22619849 22581729 797678 804205 6528 -2.00E-04 Tumor_53 18 22619901 22620131 231 804206 804208 3 0.0052 Tumor_53 18 22620365 49520847 26900483 804209 813412 9204 2.00E-04 Tumor_53 18 49521083 49521378 296 813413 813418 6 -0.0029 Tumor_53 18 49532255 61913268 12381014 813419 817700 4282 0 Tumor_53 18 61918108 61918890 783 817701 817703 3 0.0049 Tumor_53 18 61926563 76115098 14188536 817704 822488 4785 1.00E-04 Tumor_53 19 41898 21597816 21555919 822489 828545 6057 0 Tumor_53 19 21607468 21614150 6683 828546 828549 4 -0.0045 Tumor_53 19 21617592 63789654 42172063 828550 840282 11733 2.00E-04 Tumor_53 20 9293 62426585 62417293 840283 860347 20065 -1.00E-04 Tumor_53 21 9758730 46921373 37162644 860348 872478 12131 -3.00E-04 Tumor_53 22 14432516 22674410 8241895 872479 875221 2743 -1.00E-04 Tumor_53 22 22680517 22726802 46286 875222 875240 19 -0.0023 Tumor_53 22 22731517 37620854 14889338 875241 880773 5533 -2.00E-04 Tumor_53 22 37625189 37626838 1650 880774 880776 3 -0.0047 Tumor_53 22 37629048 37679973 50926 880777 880795 19 0 Tumor_53 22 37693553 37705241 11689 880796 880819 24 -0.0029 Tumor_53 22 37719562 49581309 11861748 880820 884887 4068 -4.00E-04 Tumor_53 23 108465 3974105 3865641 884888 885324 437 -0.0017 Tumor_53 23 3974695 3979261 4567 885325 885326 2 0.0024 Tumor_53 23 3979915 154835536 150855622 885327 933827 48501 -0.0018